Protein–RNA interactions for Protein: P01671

Ig kappa chain V-III region PC 7175, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01671 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01671 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01671 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01671 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01671 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01671 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01671 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01671 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01671 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01671 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01671 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01671 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01671 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms