Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms