Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfdp1O88271 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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