Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms