Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ldb2O55203 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ldb2O55203 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ldb2O55203 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ldb2O55203 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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