Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CrxO54751 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms