Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc27a2O35488 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms