Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms