Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
EllO08856 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
EllO08856 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
EllO08856 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
EllO08856 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
EllO08856 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
EllO08856 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
EllO08856 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EllO08856 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EllO08856 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms