Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms