Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp12O08736 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp12O08736 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms