Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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