Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms