Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms