Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5849J3QPE5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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