Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21900J3QP38 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms