Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms