Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20918J3QN17 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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