Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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