Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms