Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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