Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms