Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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