Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms