Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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