Protein–RNA interactions for Protein: F6ZR08

Gm15056, Predicted gene 15056, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15056F6ZR08 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm15056F6ZR08 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms