Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms