Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms