Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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