Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20425E9Q035 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms