Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms