Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc17E9PVB5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ttc17E9PVB5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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