Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms