Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d4D3YUH6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms