Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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