Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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