Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms