Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms