Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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