Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M5A7VMS3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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