Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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