Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Rtf1A2AQ19 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms