Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms