Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam43bA2AM80 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms