Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms