Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms