Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms