Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Crlf3Q9Z2L7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Crlf3Q9Z2L7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Crlf3Q9Z2L7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Crlf3Q9Z2L7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Crlf3Q9Z2L7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Crlf3Q9Z2L7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Crlf3Q9Z2L7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Crlf3Q9Z2L7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Crlf3Q9Z2L7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.9 ms