Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cldn7Q9Z261 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cldn7Q9Z261 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Cldn7Q9Z261 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 352.2 ms