Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms